税种不一样：印花税是对经济活动和经济交往中书立、领受具有法律效力的凭证的行为所征收的一种税。契税是指不动产(土地、房屋)产权发生转移变动时，就当事人所订契约按产价的一定比例向新业主(产权承受人)征收的一次性税收。
征税对象不一样：在中华人民共和国境内书立、领受《中华人民共和国印花税暂行条例》所列举凭证的单位和个人，都是印花税的纳税义务人，应当按照规定缴纳印花税。契税的征税对象是境内转移的土地、房屋权属。
起源不一样：印花税的名称来自于中国。
《中华人民共和国契税暂行条例细则》第一条
《印花税暂行条例》第一条
