如果公司法人代表不是股东会有许多弊端。法定代表人，必须是法人组织的负责人，能够代表法人行使职权。股东承担的是出资的责任。两者所要承担的责任不同，如果企业法人和股东协调不好关系，会使企业在各种总大决策问题上出现许多纰漏，给企业造成一定的经济损失。但也有一定的好处。
简单说，法人是企业的负责人。股东只是公司的资金投入者。在一般的公司管理中，法人享有经营管理的权力，而股东只是投资者，不能对公司业务进行经营和管理。
在跟其他公司签合同时，只有企业法人签字才有效。股东不具备经营权。如果将来企业出现问题，要是倒闭的话，企业的财产将有股东投资入股的份额进行分配。这时，法人只是经营者，不能对企业财产进行分配。
1、股东:是公司的投资者,由股东构成股东会,而股东会是公司的最高权力机构，决定公司的一切重大事务。有限责任公司必须有股东会机构，但外商投资设立的有限公司法律规定只设董事会，由董事会代行股东会的权力，国有独资公司也不设股东会，重大问题由董事会请示国家授权的机构决定。股东会不是公司的常设机构，股东因故不能参加股东会时，可书面委托他人代为行使权利。股东会的职权有：决定公司的经营方针和投资计划;选举和更换董事、监事并决定他们的报酬标准;审查批准董事会的报告;审查批准监事会或监事的报告;审批公司的财务预算或决算方案;审议批准公司的利润分配方案和弥补亏损方案;对公司增加或减少注册资本作出决议;对发行公司债券作出决议;对股东向股东以外的人转让出资作出决议;对公司合并、分立、变更公司形式、解散和清算事项作出决议;修改公司章程。股东会议事和表决须按公司法规定的程序进行。
法人：生活中人们说到法定代表人时总说成法人。但在法律上，两者是完全不同的主体。 法人是指民法赋予权利能力的基于成员或者独立财产所形成的团体，不是单个的自然人。民法学将基于成员的团体称为社团，其成员相应称为社员;基于捐助财产以财产为成立基础的团体称为财团。但我国《民法通则》将法人定义为具有民事权利能力和民事行为能力，依法独立享有民事权利和承担民事义务的组织，并将法人分为企业法人和非企业法人。后者分为国家机关事业单位法人，社会团体法人。各类公司都是企业法人，但独资企业、合伙企业不是法人。 法人作为团体，要像一个完全民事行为能力人那样以自己名义参与生活、介入市场，必须设有法人机关。法人机关由意思机关、执行机关、代表机关和监察机关构成。
《民法通则》规定：依照法律或者法人组织章程规定，代表法人行使职权的负责人，是法人的法定代表人。《公司法》规定：董事长为公司的法定代表人;有限责任公司不设董事会的，执行董事为公司的法定代表人。这个法定代表人实际上是法人机关中的代表机关的担当人，是一个自然人。法定代表人是法人对外活动的当然代表，其行为即为法人的行为，所以《民法通则》规定：法人对代表机关及其他经授权代表法人者实施的行为，负担责任。 法定代表人和法人的代理人也不同。除法定代表人以外，代表法人进行对外活动，必须有法人合法授权，否则其行为不能视为法人的行为。 签合约的是公司代表，而不是法定代表人。建议你控制好合同章，所有合约的签署关键在你盖的章，如果没有合同章你可以视为个人行为。
综上所述，公司法人代表不是股东，对于制约企业发展会有一定的影响，但是对于法人和股东的职位，可以通过股东大会决策更换法人和股东的职位，给企业决策者一定的危机感，有利于促进企业走正规化发展的道路，杜绝企业决策者徇私舞弊，行贿受贿的苗头。对于企业可以群策群力。
