黑白合同更多地是从行政管理角度，着眼合同是否经过法定的登记、备案程序进行的定义，一旦因此发生民事纠纷，则必然涉及对其效力问题的判断。在笔者最近代理的一起诉讼案件中，黑白合同的效力问题就成了案件焦点。当事人先签订一份反映其真实意思的股权转让合同，即黑合同;在办理股权变更登记时又临时签订了一份内容简单的股权转让合同，即白合同，其中约定价款远低于真实意思表示。之后，由于新股东无法兑现发展公司的承诺，原股东提出解除股权转让合同，并要求赔偿损失。在诉讼中，对于白合同的评价成了原告的难题，如果说白合同有效，则其中价款无法接受;如果说白合同无效，则已完成的股权转让行为欠缺合法的合同依据。另外，白合同中不仅价款与真实意思不一致，其套用的模板中还无意地约定了仲裁条款，这样一来，法院管辖也成了问题。因为即便白合同无效，仲裁条款作为解决争议的条款，也会独立出来适用。
股权转让中黑白合同现象的普遍存在是不能回避的现实。就当事人之间的民事争议来说，法院应判断双方真实意思，以此处理民事法律关系纠纷;对于相关行政责任，比如补交税款以致行政处罚，由行政机关进行追究，法院在审理股权转让纠纷过程中发现了行政违法行为，可向相关行政机关发出司法建议。
其实黑白合同并非规范的法律术语，相较而言，似乎其中的白合同的名称更易被接受。有观点认为，白合同经过国家行政机关登记或备案，经过公证、登记的书证，其证明力一般大于其他书证、视听资料和证人证言;因此，白合同效力更高;从形成时间来看，往往载明真实意思的黑合同订立时间在前，登记备案的白合同订立时间在后，由此会有一种说法，形成在后的合同对之前合同条款进行了变更。
在黑白合同同样常见的建筑工程招投标领域，《最高人民法院关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》规定：“当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据。”该司法解释实际强调了白合同的法律效力。
综上，是否可以说白合同有效而黑合同无效，或者说白合同效力优于黑合同?结论并非如此。
合同效力并非证据的证明力，根据合同法理论，合同的效力包括有效、无效和效力待定等类型，并未区分效力的强弱。
黑白合同共同存在，其中哪一份是真实意思的表示，在实践中往往一目了然，即便白合同订立在后，但实际履行的却是黑合同，因此，并不能因为订立时间有先后而牵强地说成是合同内容的变更。
《民法典》第一百四十六条 【虚假表示与隐藏行为的效力】行为人与相对人以虚假的意思表示实施的民事法律行为无效。
以虚假的意思表示隐藏的民事法律行为的效力，依照有关法律规定处理。
第一百四十七条 【基于重大误解实施的民事法律行为的效力】基于重大误解实施的民事法律行为，行为人有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
第一百四十八条【以欺诈手段实施的民事法律行为的效力】一方以欺诈手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受欺诈方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
第一百四十九条【受第三人欺诈的民事法律行为的效力】第三人实施欺诈行为，使一方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，对方知道或者应当知道该欺诈行为的，受欺诈方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
第一百五十条【以胁迫手段实施的民事法律行为的效力】一方或者第三人以胁迫手段，使对方在违背真实意思的情况下实施的民事法律行为，受胁迫方有权请求人民法院或者仲裁机构予以撤销。
涉及到黑白合同或者是阴阳合同之间的问题，首先双方在签署合同的时候，就应该实行进行约定好怎样解诀发生矛盾纠纷，一般黑合同很有可能会被视为无效合同，但是如果双方在签署黑格同时是属于正规有效的方式进行签订的话，也有可能会被认定为有效合同。
