一、没结婚证有两个小孩想分开怎么办?
首先，你们没有领结婚证，婚姻关系不受法律保护，不存在离婚问题。
其次，对于同居期间产生的财产可协商分配，或证明是个人所有财产，若不能证明为一方所有的，按一般共有财产处理。
再次，虽然不存在法律上的夫妻关系，但基于自然血亲孩子是你们两个人的孩子，如果你们要分开，要协议孩子的监护权有谁行使，若不成可诉讼。
一般的同居关系：
1、双方不以夫妻名义——恋爱或者性伙伴关系。解除同居时，同居期间的财产，能证明为一方财产的，归该个人所有;不能证明为一方所有的，按一般共有财产处理。
这里的共有，应理解为为“共同共有”。
根据《民法典》（2021年1月1日起实施）
第三百零八条 共有人对共有的不动产或者动产没有约定为按份共有或者共同共有，或者约定不明确的，除共有人具有家庭关系等外，视为按份共有。
同居双方显然不具有家庭关系，该共有应当为“按份共有”。
2、同居双方以夫妻名义。一是形成事实婚姻关系的，这种同居解除时，因双方形成了事实婚姻，财产分割按夫妻共同财产处理。二是没有形成事实婚姻，同居关系解除时，按照第1种情况处理。
二、没结婚证孩子抚养权归谁?
1、两周岁以下的子女，一般随母方生活。母方有下列情形之一的，可随父方生活：
(1)患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，子女不宜与其共同生活的;
(2)有抚养条件不尽抚养义务，而父方要求子女随其生活的;
(3)因其他原因，子女确无法随母方生活的。
2、父母双方协议两周岁以下子女随父方生活，并对子女健康成长无不利影响的，可予准许。
3、对两周岁以上未成年的子女，父方和母方均要求随其生活，一方有下列情形之一的，可予优先考虑：
(1)已做绝育手术或 因其他原因丧失生育能力的;
(2)子女随其生活时间较长，改变生活环境对子女健康成长明显不利的;
(3)无其他子女，而另一方有其他子女的;
(4)子女随 其生活，对子女成长有利，而另一方患有久治不愈的传染性疾病或其他严重疾病，或者有其他不利于子女身心健康的情形，不宜与子女共同生活的。
4、父方与母方抚养子女的条件基本相同，双方均要求子女与其共同生活，但子女单独随祖父母或外祖父母共同生活多年，且祖父母或外祖父母要求并且有能力帮助子女照顾孙子女或外孙子女的，可作为子女随父或母生活的优先条件予以考虑。
虽然有两个小孩了，但没有领取结婚证就不属于法律意义上的婚姻关系，自然不存在办离婚证这事。两个人只需要处理好各自财产问题，另外毕竟有两个小孩需要负责照顾，应商量好孩子的归属和抚养问题，能友好协商更好，不行则可诉讼解决。
