不算自动离婚。
首先，分居两年并不能成为离婚的理由。生活中，夫妻分居的原因有很多种，比如异地工作等等。因此，并不是只要分居就可以作为离婚的理由。按照法律的规定，必须是因为感情不和分居导致分居满两年，才可以作为离婚的理由。
其次，因感情不和导致分居满两年只是法院作为判定准予双方离婚与否的一个考虑因素，法院必须根据整个案情，判断夫妻感情是否确已破裂。
最后，因感情不和导致分居满两年不能自动离婚。法律没有规定分居可以自动离婚，离婚必须按照法律程序进行，分居两年不可以自动离婚、分居多久都不可以自动离婚。
《民法典》第一千零七十九条 夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
