首先，不存在自动离婚的说法，离婚只有两种方式，协议离婚和诉讼离婚。协议离婚，需要您双方对于是否离婚、孩子抚养权、财产分割等内容达成一致意见，形成纸质的离婚协议书，并携带双方的户口本原件、身份证原件、结婚证原件到任意一方户籍所在地的民政局办理手续;诉讼离婚，您需要携带起诉状，身份证原件及复印件2份，结婚证原件及复印件2份，对方的居住证明或是户籍证明到对方的经常居住地或是户籍所在地的法院起诉，并于法院规定的日期前交纳诉讼费缴纳完毕诉讼费后，您可以拨打12368(如是外地地区，前加区号)查询法官，并与法官沟通开庭时间，之后您耐心等待开庭就可以。
您提到分居应该是因为误以为分居满两年可以自动离婚，确实有法律规定，感情不合分居满两年，调解无效的，应准予离婚，但是在实践中，“应”该属于法官自由裁量，法官往往更看重当事人是第一次起诉还是第二次起诉，一般来说，第一次起诉对方不同意离婚的，法官都不会判决离婚，第二次起诉，不存在特殊情况，90%以上都会判决离婚。第一次起诉加第二次起诉一起时间是3个月到1年左右。如果您想尽快离婚，需要尽快起诉。
法律依据：《婚姻登记条例》
第十一条 办理离婚登记的内地居民应当出具下列证件和证明材料：
(一)本人的户口簿、身份证;
(二)本人的结婚证;
(三)双方当事人共同签署的离婚协议书。
办理离婚登记的香港居民、澳门居民、台湾居民、华侨、外国人除应当出具前款第(二)项、第(三)项规定的证件、证明材料外，香港居民、澳门居民、台湾居民还应当出具本人的有效通行证、身份证，华侨、外国人还应当出具本人的有效护照或者其他有效国际旅行证件。离婚协议书应当载明双方当事人自愿离婚的意思表示以及对子女抚养、财产及债务处理等事项协商一致的意见。
