农业户口和非农业户口的主要区别在于它们的权益不同：
1.农业户口的权益，主要是宅基地和责任田，特别是在城市化过程中，通过拆迁，可获得更多收益。
2.非农业户口的权益，主要是依附在户籍上的一些社会福利，包括教育、医疗、就业、保险、住房等方面。
3.非农业户口的福利一般更好。比如养老金，非农业户口就要比农业户口多很多，并且沿袭多年，已经很成熟和完善，但农村养老金建立不满10年。还有医疗保险，农业户口参保的新农合一般只保大病，住院才可以报销，但居民和职工的医疗保险，不但住院可以报销，门诊看病也可以报销，退休后还有各项医疗费报销待遇。
二、非农业户口的福利优势
非农业户口的居民虽然不能拥有各自的责任田或者宅基地，但是福利比农业户口的居民好很多。
1、就业优势
非农户口相比农业户口有一个最大的区别就是城市有一个劳动再就业的政策，其他的没有太大区别，不过政府对于农村的投入在就业方面和城市在就业方面的投入相比会少很多，还有一个不同即是在从军、退役、退役后自谋职业等方面城市户口的人员会比农业户口的人员取得的补助更多。
2、教育优势
城市里的一些优质教育资源对于当地城市户口居民来讲门槛较低，而如果是农村户口可能要缴纳一定的费用才能就读，并且其他的门槛也更高一些。
3、社会保险
基本农业户口和非农业户口的差别是很小的，大学毕业的人会有一个感触就是如果是农业户口单位缴纳三险一金，如果是城镇户口则给缴纳五险一金，其他基本都是一体化了，不过在一些失业保险方面存在一定的差别。
农业户口还有非农业户口都由各自的优势还有劣势，非农业户口的优势包括社会保险的优势，教育方面优势还有就业方面的优势，城镇户口的一般会缴纳五险一金，城市户口的教育资源门槛较低等。
