不会扣分的。根据道路交通安全法规定，信号灯黄灯表示警示，并规定机动车遇路口时应减速通过，黄灯亮时已经越过停止线的车辆可以继续通过，还未越过停止线的车辆应停车。
《中华人民共和国道路交通安全法》
第二十六条 交通信号灯由红灯、绿灯、黄灯组成。红灯表示禁止通行，绿灯表示准许通行，黄灯表示警示。
《道路交通安全法实施条例》
第三十八条第二款：黄灯亮时，已越过停止线的车辆可以继续通行;
法律依据：《交通法规扣分细则》
第六十九条
机动车驾驶人在一个记分周期内记分未达到12分，所处罚款已经缴纳的，记分予以清除;记分虽未达到12分，但尚有罚款未缴纳的，记分转入下一记分周期。
