若劳动者的工资超过5000以上，则需缴纳个人所得税。
根据法律规定，用人单位代扣代缴的个人所得税的，可以代扣劳动者工资。
用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。法律依据：《工资支付暂行规定》第十五条
用人单位不得克扣劳动者工资。
有下列情况之一的，用人单位可以代扣劳动者工资：
（一）用人单位代扣代缴的个人所得税；
（二）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；
（三）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；
（四）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。
《中华人民共和国个人所得税法》第九条
个人所得税以所得人为纳税人，以支付所得的单位或者个人为扣缴义务人。
纳税人有中国公民身份号码的，以中国公民身份号码为纳税人识别号；
纳税人没有中国公民身份号码的，由税务机关赋予其纳税人识别号。
扣缴义务人扣缴税款时，纳税人应当向扣缴义务人提供纳税人识别号。
