补发工资的个税申报应当向主管税务机关提供书面说明，情况属实的，可将补发工资分摊与所属月份工资薪金所得合并计算缴纳个人所得税。所以如果单位补发工资，应当向主管税务机关提供书面说明，情况属实的，可将补发工资分摊与所属月份工资薪金所得合并计算缴纳个人所得税。但是各地的政策可能有所不同，以当地政策为准。
《中华人民共和国个人所得税法》第十二条 纳税人取得经营所得，按年计算个人所得税，由纳税人在月度或者季度终了后十五日内向税务机关报送纳税申报表，并预缴税款；在取得所得的次年三月三十一日前办理汇算清缴。
纳税人取得利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得和偶然所得，按月或者按次计算个人所得税，有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次代扣代缴税款。
