妨害传染病防治罪，是严重危害人类健康和扰乱社会管理秩序的犯罪。本罪的成立是指违反传染病防治法规定，引起甲类传染病传播或者有传播严重危险的行为。
一、本罪侵害的客体是我国卫生行政部门对传染病特别是甲类传染病的防治和管理秩序，同时也危及人民的生命健康安全。客观方面表现为具有违反我国传染病防治的行为，并且由此引起甲类传染病的传播或者具有传播的严重危险。主观方面是故意，即明知是违反传染病防治法的行为，而以作为或不作为的方式有意实施该类行为。但对于引起甲类传染病传播或具有传播的严重危险这一后果，行为人主观上可能是过失。主体除一般主体外，还包括单位。
二、本罪与违反国境卫生检疫规定罪的区别。两者犯罪主体不同，本罪为一般主体，后者为出境入境人员。客观方面本罪表现为违反传染病防治法，引起了甲类传染病传播或有传播严重危险的行为;后者表现的违反国家国境卫生检疫管理规定，引起检疫传染病传播或有传播严重危险的行为。后者所指的传染病范围要大于前者。
三、本罪原是依照《传染病防治法》而设立的罪名。原是比照1979年《刑法》第一百八十七条违反国境卫生检疫规定罪处罚。新刑法单独规定了罪名和法定刑，并增设了单位犯罪。
