非法经营罪立案标准是个人非法经营数额在五万元以上，或者违法所得数额在一万元以上的非法经营活动，予以立案追诉。依据如下：
一、根据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定(二)》第79条第八项规定违反国家规定，进行非法经营活动，扰乱市场秩序，涉嫌下列情形之一的，应予立案追诉：
1、个人非法经营数额在五万元以上，或者违法所得数额在一万元以上的；
2、单位非法经营数额在五十万元以上，或者违法所得数额在十万元以上的；
3、虽未达到上述数额标准，但两年内因同种非法经营行为受过二次以上行政处罚，又进行同种非法经营行为的；
4、其他情节严重的情形。
二、根据《中华人民共和国刑法》（修订）规定，有下列行为的也属于非法经营，也会受到处罚。
第二百二十五条违反国家规定，有下列非法经营行为之一，扰乱市场秩序，情节严重的，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产：
（一）未经许可经营法律、行政法规规定的专营、专卖物品或者其他限制买卖的物品的；
（二）买卖进出口许可证、进出口原产地证明以及其他法律、行政法规规定的经营许可证或者批准文件的；
（三）未经国家有关主管部门批准非法经营证券、期货、保险业务的，或者非法从事资金支付结算业务的。
