当事人对行政处罚部分，申请复议后仍然部分，提起行政诉讼的，要做到以下几点。
1，确定管辖的法院。当事人可以到最初作出行政行为的行政机关所在地人民法院起诉，也可以由复议机关所在地人民法院起诉。
2，确定被告比较复杂。
（1）经复议的案件，复议机关决定维持原行政行为的，作出原行政行为的行政机关和复议机关是共同被告；
（2）复议机关改变原行政行为的，复议机关是被告。
（3）复议机关在法定期限内未作出复议决定，公民、法人或者其他组织起诉原行政行为的，作出原行政行为的行政机关是被告；
（4）起诉复议机关不作为的，复议机关是被告。
（5）两个以上行政机关作出同一行政行为的，共同作出行政行为的行政机关是共同被告。
（6）行政机关委托的组织所作的行政行为，委托的行政机关是被告。
（7）行政机关被撤销或者职权变更的，继续行使其职权的行政机关是被告。
3，到相应的法院起诉即可。
《中华人民共和国行政诉讼法》
第十八条行政案件由最初作出行政行为的行政机关所在地人民法院管辖。经复议的案件，也可以由复议机关所在地人民法院管辖。
经最高人民法院批准，高级人民法院可以根据审判工作的实际情况，确定若干人民法院跨行政区域管辖行政案件。
第二十六条公民、法人或者其他组织直接向人民法院提起诉讼的，作出行政行为的行政机关是被告。
经复议的案件，复议机关决定维持原行政行为的，作出原行政行为的行政机关和复议机关是共同被告；复议机关改变原行政行为的，复议机关是被告。
复议机关在法定期限内未作出复议决定，公民、法人或者其他组织起诉原行政行为的，作出原行政行为的行政机关是被告；起诉复议机关不作为的，复议机关是被告。
两个以上行政机关作出同一行政行为的，共同作出行政行为的行政机关是共同被告。
行政机关委托的组织所作的行政行为，委托的行政机关是被告。
行政机关被撤销或者职权变更的，继续行使其职权的行政机关是被告。
