二者区别如下：
1.商业秘密是企事业单位已经掌握的技术或者信息；竞业禁止是针对相关核心人员固有技能的。
2.商业秘密原则上属于法定附随义务，只要圈定了商业秘密的范围并和员工有了明确说明就应该遵守保守商业秘密的约定；竞业禁止属于约定义务，他限制了员工离职后的自由择业权利。
3.保守商业秘密原则上没有期限限制；竞业禁止因为牵涉到个人利益和社会生产力发挥的问题，一般是有法律明确规定限制的。
【法律依据】
《劳动合同法》
第二十三条
用人单位与劳动者可以在劳动合同中约定保守用人单位的商业秘密和与知识产权相关的保密事项。对负有保密义务的劳动者，用人单位可以在劳动合同或者保密协议中与劳动者约定竞业限制条款，并约定在解除或者终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予劳动者经济补偿。劳动者违反竞业限制约定的，应当按照约定向用人单位支付违约金。
