一、患者死亡医患双方不能确定死因怎么办
患者死亡，医患双方当事人不能确定死因或者对死因有异议的，应当在患者死亡后四十八小时内进行尸检，具备尸冻存条件的，可以延长至七日。尸检应当经死者近亲属同意并签字。
尸检应当由按照国家有关规定取得相应资格的机构和病理解剖专业技术人员进行。承担尸检任务的机构和病理解剖专业技术人员有进行尸检的义务。
医疗事故争议双方当事人可以请法医病理学人员参加尸检，也可以委派代表观察尸检过程。拒绝或者拖延尸检，超过规定时间，影响对死因判定的，由拒绝或者拖延的一方承担责任。
患者在医疗机构内死亡的，尸体应当立即移放太平间。死者尸体存放时间一般不得超过2周。逾期不处理的尸体，经医疗机构所在地卫生行政部门批准，并报经同级公安部门备案后，由医疗机构按照规定进行处理。
发生医疗事故争议时，患者死亡原因难以确定或医患双方参死亡原因有异议的，医疗机构和死者近亲属如何申请尸检?
发生医疗事故争议时，患者死亡原因难以确定或医患双方参死亡原因有异议的，医疗机构和死者近亲属均可以提出进行尸检的要求。根据《民法通则》规定，尸体的处置权属于死者近亲属，其他任何单位和个人无权处置。因此，必须经死者近亲属同意并签字后方可进行尸检。
医疗尸检可以由病人家属提出，也可以由医疗机构提出。由医疗机构提出尸体检验要求的，必须取得病人家属的同意。在签订《尸体检验协议书》后，医患双方共同选择由卫生行政部门指定具有尸检资格的鉴定机构。
二、医疗纠纷处理办法有几种
患方取得病历等资料后，即可加以初步研究。必要时可以向医疗专家、法律专家咨询，以便大致明确是否属于医疗事故以及医方有无过错责任。患方认为医方应承担责任而与医方发生医疗纠纷时，目前有以下三种解决途径：
1、与医方协商解决。
依据《医疗事故处理条例》第五章第四十六条之规定，发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决。值得注意的是，在司法实践中，就人身损害当事人自愿达成和解协议，一方反悔向人民法院起诉的，应保护其诉权，但其不能证明在订立协议时具有无效或者可撤销情形的，应认定协议有效。
2、申请卫生行政部门处理。
《医疗事故处理条例》第三十七条、第三十八条规定，发生医疗事故争议时，当事人可以向医疗机构所在地县级人民政府卫生行政部门提出医疗事故争议处理的书面申请。书面申请应在自当事人知道或者应当知道其身体健康受到损害之日起1年内提出。
3、到人民法院提起民事诉讼。
目前，到人民法院提起医疗赔偿纠纷诉讼，不以医疗事故技术鉴定为前提。患方的举证责任集中在患者人身损害后果(身体健康损害、死亡等)和与医疗机构的医疗关系(病历、医疗费单据等)上。《最高人民法院关于参照〈医疗事故处理条例〉审理医疗纠纷民事案件的通知》规定：《医疗事故处理条例》施行后发生的因医疗事故引起的医疗赔偿纠纷，诉到法院的，参照《医疗事故处理条例》的有关规定办理;因医疗事故以外的原因引起的其他医疗赔偿纠纷，适用民法通则的规定。人民法院在民事审判中，根据当事人的申请或者依职权决定进行医疗事故司法鉴定的，交由《医疗事故处理条例》所规定的医学会组织鉴定;因医疗事故以外的原因引起的其他医疗赔偿纠纷需要进行司法鉴定的，按照《人民法院对外委托司法鉴定管理规定》组织鉴定。
明确上述医疗纠纷解决途径的特点后，患方应果断选择较适合的途径，以免在不必要的问题上延误时间，造成被动。
综上所述，如果患者死亡医患双方不能确定死因的话，可以尸检，这个办法可以确定患者死亡的原因。但是死亡患者的尸体由患者家属决定要不要尸检，如果家属不愿意尸检的话，不能强求。在发生医疗事故后患者家属与医院应该协调解决，不能解决的话向法院起诉可以保护当事人的利益。
