专利申请过程中被侵权怎么处理

1、协商与和解：专利权人和被控侵权人均可自行协商或在其他第三方的调解、斡旋下达成和解协议，解决纠纷。
2、行政查处：专利权人在掌握初步证据的情况下，可向专利局等有关行政部门举报，由其采取行政措施，对侵权人的侵权行为进行调查核实后作出是否侵权的认定。在行政查处过程中，有关专利行政部门基于有关当事人的申请，可对专利侵权的民事责任进行调解。
3、向法院起诉：专利权人亦可径自向侵权行为地、被告所在地等相关人民法院提起民事诉讼，要求停止侵权行为赔偿经济损失等。
《中华人民共和国专利法》第六十条