1.定义不同：软件著作权是指软件的开发者或者其他权利人依据有关著作权法律的规定，对于软件作品所享有的各项专有权利。专利是由政府机关或者代表若干国家的区域性组织根据申请而颁发的一种文件，获得专利的发明创造在一般情况下他人只有经专利权人许可才能予以实施。
2.法律依据不同：软件著作权保护主要依据《著作权法》和《计算机软件保护条例》，专利的保护主要依据《专利法》、《中华人民共和国知识产权法》。
3.申请方式不同：软件著作权写完就自然受到保护，不需要经过审核，提交材料符合规范就可以获得。专利需要经过形式审查和实际审查，要满足新颖性、创造性、实用性等诸多要求，才能够受到保护。
4.简易程度不同：软件著作权获权简单，维权简单，保护力度弱，产生的效益通常是收取授权费用。专利获权困难，维权复杂，保护力度强，产生的效益大而且持久。
法律依据：《著作权》 第三条
著作权登记登记涉及著作权法第三条所列的作品,如文字作品、口述作品、美术摄影作品、影视作品、音乐作品,录像作品、工程和产品设计图纸及其说明等。版权登记包括以下列形式创作的文学、艺术和自然科学、社会科学、工程技术等作品。
