约定了按揭房屋归属的房屋该如何处理

视具体情况而定。如果是离婚分割财产，约定的是房屋属于双方共同所有的，那么是夫妻共同财产，房屋由双方协商进行分割，如果协商不一致，那么可以向法院起诉。
《民法典》第一千零八十七条离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。对夫或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。