一般清算时根据现有资产（不仅包括存货、固定资产，还包括应收账款、现金等流动资产）的变现价值来核算，不会根据亏损进行减值调整的，而是根据现有资产按照比例进行分配，并且清算的时候要先支付公司员工的工资，再偿还借款，之后才是股东按出资比例分配。
法律依据：《中华人民共和国合伙企业法》 第十八条
合伙协议应当载明下列事项：(一)合伙企业的名称和主要经营场所的地点;(二)合伙目的和合伙经营范围;(三)合伙人的姓名或者名称、住所;(四)合伙人的出资方式、数额和缴付期限;(五)利润分配、亏损分担方式;(六)合伙事务的执行;(七)入伙与退伙;(八)争议解决办法;(九)合伙企业的解散与清算;(十)违约责任。
