灵活就业社保和职工社保的区别如下：
1、参加的险种不同：灵活就业人员：社保只参加养老保险和医疗保险，部分地区可参加失业保险。
在职职工：在职职工参加的社保包括养老保险、医疗保险、工伤保险、生育保险和失业保险，就是我们常说的“五险”。
2、缴费基数不同：灵活就业人员：按上年全省在岗职工月平均工资的40%-100%为缴费基数。在职职工：按本人上年度月平均工资为缴费基数。
3、缴费比例不同：灵活就业人员：养老保险缴费比例为20%，医疗保险缴费以当地上年度城镇在岗职工月平均工资的80%为基数，按4.2%或8%比例缴纳基本医疗保险费。
法律依据：《中华人民共和国社会保险法全文》
第六十四条
社会保险基金包括基本养老保险基金、基本医疗保险基金、工伤保险基金、失业保险基金和生育保险基金。除基本医疗保险基金与生育保险基金合并建账及核算外，其他各项社会保险基金按照社会保险险种分别建账，分账核算。社会保险基金执行国家统一的会计制度。社会保险基金专款专用，任何组织和个人不得侵占或者挪用。 基本养老保险基金逐步实行全国统筹,其他社会保险基金逐步实行省级统筹，具体时间、步骤由国务院规定。
