工程款纠纷诉讼时效三年内起诉有效。
根据《最高人民法院关于审理民事案件适用诉讼时效制度若干问题的规定》第6条规定“未约定履行期限的合同，依照合同法（自2021年1月1日起废止）第六十一条、第六十二条的规定，可以确定履行期限的，诉讼时效期间从履行期限届满之日起计算。”
1、施工合同中一般都有支付工程款的时间约定;
2、如果没有书面的施工合同，那么就是在工程竣工验收后，可以主张要求支付工程款;
3、追偿工程款适用三年的诉讼时效。
《民法典》第一百八十八条 向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
