根据《中华人民共和国刑法》第425条的规定，犯本罪的，处3年以下有期徒刑或者拘役;造成特别严重后果的，处3年以上7年以下有期徒刑;战时犯本罪的，处5年以上有期徒刑。“造成特别严重后果”，指造成战斗失利或者战役严重受挫的，贻误重要战机的，严重影响部队完成重要任务的，造成重大责任事故的，等等。
本罪的基本特征：
①侵犯的直接客体是指挥和值班、执勤秩序。
②客观方面表现为擅离职守或玩忽职守，并且造成严重后果的行为。“擅离职守”，指擅自离开正在履行职责的岗位。“玩忽职守”，指在履行职责的岗位上，严重不负责任，不履行或者不正确履行职责。“造成严重后果”，指造成重大任务迟缓完成或者不能完成的，造成人员重伤死亡的，造成武器装备、器材丢失、被盗的，造成重大经济损失的，等等。
③犯罪主体是军队的指挥人员和值班、值勤人员。“指挥人员”，指对部队或者部属负有组织、领导、管理职责的军人，专业主管人员在其业务管理范围内，视为指挥人员。“值班人员”，指军队各单位、各部门为保持指挥或者履行职责不间断而设立的、定期轮流负责处理本单位、本部门特定事务的人员。“值勤人员”，指正在担任警卫、巡逻、纠察、押运等勤务，或者担任作战勤务工作的人员。
④主观方面是过失，即行为人应当预见自己擅离职守或玩忽职守的行为可能造成严重后果，但因为疏忽大意而没有预见，或者已经预见而轻信能够避免。
擅离职守是指行为人擅自离开正在履行职责的岗位。玩忽职守是指行为人在履行职责的岗位上，严重不负责任，不履行或者不正确履行职责。从广义上看，玩忽职守不仅包括擅离职守，而且也包括了滥用职权的行为，因为滥用职权也属于不正确履行职责。所以对符合擅离、玩忽军事职守罪其他构成要件的滥用职权行为，可直接以擅离、玩忽军事职守罪论处，不必适用本法第397条定滥用职权罪。如在飞行训练中，飞行指挥员随意改变训练计划，造成飞行事故的行为，即属于这种情况。
坚守岗位是作为一名军人或者是国家工作人员的职责。在岗期间，任何国家工作人员以及军人都是不能够擅离职守的，如果一旦出现擅离职守，导致造成重大任务迟缓，甚至于有伤亡现象的话，将会造成不可估量严重的后果影响。
