不同动产的抵押登记机关有：
1、企业设备、原辅材料、产品或商品等，工商部门，《企业动产抵押物登记管理办法》;
2、非农用机动车，车辆管理局，《机动车登记办法》;
3、农用机器设备，农机站;
4、农作物和其他农业收获物，农业局;
5、果园、树林，林业局;
6、船舶《海商法》所指，海事局《海商法》、《船舶登记条例》;
7、渔业船舶，渔政渔港监督管理局，《渔业船舶登记办法》;
8、民用航空器，民用航空管理部门，《民用航空法》。
【法律依据】《民法典》第四百零三条 以动产抵押的，抵押权自抵押合同生效时设立;未经登记，不得对抗善意第三人。
